Герман Абендрот родился во Франкфурте-на-Майне в семье книготорговца. В 1900—1903 годах обучался в Мюнхенской консерватории по классам теории и композиции (у Людвига Тюйе), фортепиано (у Анны Хирцель-Лангенхам) и дирижирования (у Феликса Моттля).
Одновременно Абендрот занимался преподавательской деятельностью, с 1919 года — профессор. В 1943—1944 годах принимал участие в вагнеровском фестивале в Байрёйте. Неоднократно гастролировал в России: в 1925, 1927, 1928, 1951 и 1954 годах; в 1954-м в Большом театре исполнил все 9 симфоний и оперу «Фиделио» Бетховена[1].