MolBiol.ru > Справочник > Мол. биол. > Аминокислоты и белки | |
|
ГЛАВНАЯ ·
БИОХИМИЯ ·
ПРОЕКТ ·
СПРАВОЧНИК ·
МЕТОДЫ ·
РАСТВОРЫ ·
РАСЧЁТЫ ·
ЛИТЕРАТУРА ·
ЗАДАЧИ ·
ФИРМЫ ·
Синтол ·
Millipore ·
Диаэм ·
Axygen ·
ДНК-синтез ·
БиоЛайн ·
Beckman Coulter ·
Хеликон ·
Химмед ·
Биосан ·
Merck KGaA ·
Waters ·
Elite-Genetix
|
Свойства аминокислот и белков
A T G C AAA K ATA I AGA R ACA T A AAG K ATG M AGG R ACG T AAT N ATT I AGT S ACT T AAC N ATC I AGC S ACC T TAA Stop1TTA L TGA Stop3TCA S T TAG Stop2TTG L TGG W TCG S TAT Y TTT F TGT C TCT S TAC Y TTC F TGC C TCC S GAA E GTA V GGA G GCA A G GAG E GTG V GGG G GCG A GAT D GTT V GGT G GCT A GAC D GTC V GGC G GCC A CAA Q CTA L CGA R CCA P C CAG Q CTG L CGG R CCG P CAT H CTT L CGT R CCT P CAC H CTC L CGC R CCC P STOP1 => ochra; STOP2 => amber; STOP3 => opal
Генетический код митохондрий Человеческая митохондриальная ДНК кодирует только 22 типа tRNA. Только эти tRNAs используются при трансляции mRNAs. Такая вырожденность достигается тем, что U в антикодоне tRNA соответствует любому основанию в третьей позиции mRNA (четыре кодона распознаются одним типом tRNA). Кроме того, значение некоторых кодонов не совпадает с универсальным кодом.
Гидрофобность аминокислот выражает степень в которой они предпочитают неполярное окружение (этанол в качестве растворителя или внутренность белка) по сравнению с полярным окружением, таким как вода. На этой диаграмме гидрофобные аминокислоты располагаются ниже нуля, а гидрофильные - выше. Используются две шкалы. Шкала Фроммеля (Frommel, 1984) выражает свободную энергию переноса из гидрофобной среды в воду. Это внутреннее свойство аминокислоты, не зависящее от роли аминокислоты в белке. OMH шкала (Sweet and Eisenberg, 1983) - мера того, на сколько вероятна замена данной аминокислоты другой гидрофобной аминокислотой. Frommel, C. 1984. The apolar surface area of amino acids and its empirical correlation with hydrophobic free energy. J. Theor. Biol. 111:247-260. Sweet, R.M. and Eisenberg, D. 1983. Correlation of sequence hydrophobicities measures similarity in three-dimensional protein structure. J. Mol. Biol. 171:479-488. Относительная оценка подобия аминокислот |
Смотри также: /ссылки на сетевые ресурсы/
|
ГЛАВНАЯ ·
БИОХИМИЯ ·
ПРОЕКТ ·
СПРАВОЧНИК ·
МЕТОДЫ ·
РАСТВОРЫ ·
РАСЧЁТЫ ·
ЛИТЕРАТУРА ·
ЗАДАЧИ ·
ФИРМЫ ·
Синтол ·
Millipore ·
Диаэм ·
Axygen ·
ДНК-синтез ·
БиоЛайн ·
Beckman Coulter ·
Хеликон ·
Химмед ·
Биосан ·
Merck KGaA ·
Waters ·
Elite-Genetix
|