1 января 2006 года вступил в действие Федеральный Закон № 131 «Об общих принципах организации местного самоуправления в Российской Федерации», который положил начало реформе органов местного самоуправления. В соответствии с данным Законом городской представительный орган местного самоуправления стал называться «Совет городского округа город Сибай Республики Башкортостан».
Выборы в Совет городского округа город Сибай второго созывасостоялись 2 марта 2008 года, выбрано 20 депутатов.
В составе Совета созданы пять постоянно действующих депутатских комиссий:
- по бюджету, налогам и вопросам собственности;
- по использованию земель и природных ресурсов, экологии и чрезвычайным ситуациям;
- по промышленности, строительству, жилищно-коммунальному хозяйству, транспорту, торговле и иным видам услуг населению;
- по социально-гуманитарным вопросам и связям с общественностью;
- по местному самоуправлению, правовым вопросам, охране прав и свобод граждан.
Кроме постоянных Комиссий Совета городского округа, действует Комиссия по соблюдению Регламанта Совета, статуса и этики депутата.
Председатель Совета, его заместитель и Председатели комиссий образуют президиум Совета городского округа город Сибай.
Имеется аппарат Совета, состоящий из муниципальных служащих, которые работают на постоянной основе. Возглавляет аппарат секретарь Совета.
Основной формой работы Совета являются заседания, созываемые не реже одного раза в два месяца.