Dzimis 1976. gada 8.jūnijā Rīgā.
Pēc izglītības ekonomists. 1999. gadā kā pirmais Latvijas Universitātes students ieguva ekonomikas bakalaura grādu specializācijā „analītiskā ekonomika”.
Dzīvojis un mācījies Dānijā. 2002. gadā saņēma Cand. oecon grādu (maģistrs pēc Latvijas sistēmas) Dienviddānijas universitātē specializācijā ekonomika un Eiropas integrācija. Strādājis Latvijas Universitātes Eirofakultātē.
Pēc tam Nils Ušakovs kļuva par žurnālistu. Strādājis gan avīzēs, gan televīzijā, kur ieņēma vadošus amatus. 2004. gadā apbalvots ar «Cicerona» balvu par ieguldījumu žurnalistikā, kuru dibinājusi Latvijas Žurnālistu savienība un Latvijas Universitāte.
Nils Ušakovs piedalījies arī plaši ārpus Latvijas pazīstamā «Baltijas foruma» darbībā, analītiskās ekonomikas jomā. Tur viņš sadraudzējās ar Jāni Urbanoviču.
2005. gada vasarā Nils Ušakovs nolēma atsaukties uz sava drauga Jāņa Urbanoviča aicinājumu pievērsties politikai un iestājās Tautas Saskaņas partijā. 2005. gada novembrī ievēlēts par Politiskās apvienības „Saskaņas Centrs” priekšsēdētāju.
Nila Ušakova vadībā apvienība «Saskaņas Centrs» guva pārliecinošus panākumus 9. Saeimas vēlēšanās, un tagad apvienībai ir otrā lielākā frakcija Saeimā. Pats Nils Ušakovs kļuva par vienu no šī parlamenta jaunākajiem deputātiem, un nodarbojas ar starptautiskās politikas jautājumiem.
Nils Ušakovs ir vienīgais Latvijas politiķis, kurš ir braucis uz Maskavu uz Vladimira Putina rīkoto pieņemšanu, un uz Vašingtonu, kur ticies ar amerikāņu kongresa locekļiem.
Par saviem svarīgākajiem uzdevumiem «Saskaņas Centra» priekšsēdētāja amatā Nils Ušakovs uzskata: 1) radīt pirmo politisko spēku Latvijas vēsturē, kur līdzās darbotos latvieši un krievvalodīgie politiķi; 2) apvienības veidošanu par ietekmīgu sociāldemokrātisku kustību.
Jau vairāk nekā gadu «Saskaņas Centrs» ir vispopulārākais politiskais spēks Latvijā, pats Nils Ušakovs dažu gadu laikā ir kļuvis par politiķi, kuram uzticas ievērojama Latvijas iedzīvotāju daļa. Bet pagājušajā gadā žurnāls „Kapitāls” ir iekļāvis Nilu Ušakovu valsts ietekmīgāko cilvēku sarakstā.
No pirmās savas pastāvēšanas dienas «Saskaņas Centrs» ir opozīcijā valdošajai elitei. Apvienība iestājās par to, lai par Latvijas prezidentu kļūtu cienīgs kandidāts – Aivars Endziņš. «Saskaņas Centrs» bija viens no tautas nobalsošanas organizatoriem par tautas tiesībām atlaist Saeimu. «Saskaņas Centra» pārstāvji un pats Nils Ušakovs piedalījās Domu laukumā gan „lietussargu revolūcijas” laikā, gan 2009. gada 13. janvārī.
Nils Ušakovs gan kā politiķis, gan kā sabiedriska persona daudz dara, lai visiem Latvijas iedzīvotājiem, neatkarīgi no dzimtās valodas un nacionalitātes, būtu vienādas iespējas.
Nils Ušakovs vienmēr aktīvi iesaistās sabiedriskajās aktivitātēs. 2006. gadā viņš kļuva par vienu no nepolitiskās jauniešu organizācijas „Mums pa ceļam!” dibinātājiem. Šīs organizācijas mērķi ir ļoti skaidri noteikti: palīdzēt skolu audzēkņiem atrast savu vietu dzīvē un gūt panākumus. Šim mērķim organizācija rīko bezmaksas lekcijas un seminārus, KVN spēles un atbalsta „Kas? Kur? Kad?” spēles, izdod savu avīzi ar 5 000 eksemplāru tirāžu, organizē braucienus uz vasaras nometnēm jaunatnei un organizē diskusiju klubu. Dažādos organizācijas pasākumos ir piedalījušies simtiem skolēnu.
Nils Ušakovs brīvi pārvalda latviešu un angļu valodas, pamatlīmenī - vācu, dāņu un zviedru valodas. Brīvajā laikā Nils Ušakovs aizraujas ar sportu – skriešanu un riteņbraukšanu.