Se forma del interés de un grupo de personas en desarrollar el deporte del Kayak y de representar a Puerto Rico en eventos internacionales.  La Federación de Canoa y Kayak de Puerto Rico es una Organización Nacional sin fines de lucro fundada en agosto de 1994. Desde el 1995 ha servido a niños, jóvenes y adultos con miras en el desarrollo del deporte en las áreas de   recreación y competición.

En el 1994 es reconocida como miembro de la Federación Internacional de Canotaje y el 1996 se afilia al Comité Olímpico de Puerto Rico.

Afiliaciones a las que la Federación Pertenece:

• Miembro del Comité Olímpico de Puerto Rico
  
• Miembro de la Federación Internacional de Canotaje
  
• Miembro de la Confederación Panamericana de Canotaje
  
• Miembro de la Confederación Centroamericana y del Caribe de Canotaje

Puerto Rico fue seleccionado por la Federación Internacional como Centro de entrenamiento Internacional para Países en desarrollo del 2007 al 2010. El actual presidente Víctor G. Ruiz dirige la Confederación Centroamericana y del Caribe y Miembro del Ejecutivo de la Federación Internacional (A cargo de Centroamérica y el Caribe).

Recientemente, en la Cena Olímpica que celebra anualmente el Comité Olímpico de Puerto Rico en honor a los atletas más destacados del año, se premió en reconocimiento por sus triunfos deportivos durante el año 2008, Krishna Angueira y Winnie Jackson.

La Federación de Canoa y Kayak de Puerto Rico fomentará el desarrollo de la práctica del Canotaje (Canoa y Kayak) en Puerto Rico y desarrollará atletas que nos representen en competencias internacionales.