Dal 1500 al 1700
38. LUDOVICO GONZAGA 1483-1511
Fratello del predecessore, Canonico della Cattedrale, Protonotario Apostolico. Designato Vescovo fin dal 1468 (?), fu nominato il 27 ottobre 1483. Solo "eletto"; spesso fuori Diocesi. Morì a Gazzuolo il 19 gennaio 1511.

39. SIGISMONDO GONZAGA 1511-1521
Nipote dei precedenti. Protonotario Apostolico. Cardinale dal 1506. Nominato Amministratore perpetuo il 9 febbraio 1511, rinunciò al nipote Ercole nel 1521. Fu Legato pontificio. Morì a Mantova nel 1525.

40. ERCOLE GONZAGA 1521-1563

Figlio di Francesco e Isabella d'Este. Commendatario di Felonica. Nominato il 10 maggio 1521. Cardinale dal 1527. Sacerdote nel 1556. Consacrato Vescovo nel 1561. Rinunciò alla Diocesi ricevuta in titolo restandone Amministratore perpetuo. Ricostruì la Cattedrale su disegno di Giulio Romano. Promosse il restauro di molte chiese. Ordinò Visite pastorali. Lasciò delle Costituzioni per il clero. Fu più volte Legato Pontificio. Reggente per i nipoti Francesco e Guglielmo. Morì a Trento, Legato "a Latere" e Presidente del Concilio Ecumenico, il 2 marzo 1563. Il suo corpo fu posto nella sagrestia della nostra Cattedrale.

41. FEDERICO GONZAGA 1563-1565
Figlio postumo del duca Federico. Cardinale nel 1563. Nominato Amministratore perpetuo il 4 giugno 1563, divenne Vescovo il 16 ottobre 1564. Morì il 22 febbraio 1565. Lasciò delle Costituzioni. E' sepolto in Cattedrale.

42. FRANCESCO GONZAGA 1565-1566
Dei Signori di Guastalla. Cardinale dal 1561. Già Vescovo di Cosenza. Nominato il 15 maggio 1565, morì in Conclave il 6 gennaio 1566.

43. GREGORIO BOLDRINI 1567-1574
Mantovano, O.P., professore di teologia. Durante il suo governo, avvenne la Visita apostolica di S. Carlo. Nominato il 7 febbraio 1567, morì il 2 novembre 1574.

44. MARCO FEDELI-GONZAGA 1574-1583
Mantovano, già Vescovo di Ossero e Alessano. Nominato il 1º dicembre 1574, morì il 29 settembre 1583. Dopo la Visita del Riformatore apostolico Angelo Peruzzi, Vescovo Suffraganeo di Bologna (1575-1576), celebrò il Sinodo e lasciò delle Costituzioni.

45. ALESSANDRO ANDREASI 1583-1593

Mantovano, pronipote della B. Osanna. Canonico e Arcidiacono della Cattedrale. Convisitatore apostolico (1575). Già Vescovo di Casale. Tenne il Sinodo e ne lasciò le Costituzioni. Nominato il 14 novembre 1583, morì il 23 marzo 1593.

46. Ven. FRANCESCO GONZAGA 1593-1620
Dei Signori di Gazzuolo, Marchese di Gazzuolo e Ostiano, O.F.M., Generale dell'Ordine. Già Vescovo di Cefalù e Pavia. Nominato il 30 aprile 1593, morì il 12 marzo 1620. Più volte compì la Visita pastorale e celebrò il Sinodo. Lasciò parecchi scritti e le Costituzioni Sinodali. Di grande santità, emerse per l'ardore apostolico e la carità. Fondò il Seminario, Istituti di beneficenza; promosse il decoro di molte chiese, specie della Cattedrale, che consacrò. Nunzio Apostolico. In diversi momenti fu celebrato il processo canonico in vista della sua beatificazione. E' sepolto nel presbiterio della Cattedrale.

47. VINCENZO AGNELLI-SUARDI 1620-1644
Mantovano, già Vescovo di Alba e Coadiutore con diritto di successione di Mantova. Nominato il 18 marzo 1620, morì il 13 settembre 1644.

48. MASSEO VITALI 1646-1669
Bergamasco, O.F.M. (Reformat.). Compì almeno due Visite pastorali e celebrò il Sinodo, lasciando le Costituzioni Sinodali. Costruì la Cappella del SS. Sacramento, in Cattedrale. Nominato il 5 febbraio 1646, morì il 23 giugno 1669.

49. TIBURZIO FERDINANDO GONZAGA 1671-1672
Cremonese, dei Signori di Vescovato. Nominato il 1º marzo 1671, morì il 28 ottobre 1672.

50. GIOVANNI LUCIDO CATTANEO 1673-1685
Mantovano, Marchese di Morano e Ponzano. Nominato il 9 dicembre 1673, morì il 2 marzo 1685. Compì la Visita pastorale e tenne il Sinodo.