1970年に４歳（現３歳）牝馬三冠競走の最終戦として創設された『ビクトリアカップ』が前身で、1975年にエリザベス女王が来日されたのを記念して、翌1976年から『エリザベス女王杯』として新たに第１回の競走が開催された。当初の競走条件はビクトリアカップを踏襲し、京都競馬場の芝2400ｍ（外回り）、負担重量は定量、４歳（現３歳）牝馬限定の混合競走であった。
その後、1996年の牝馬競走体系の整備に伴い、競走条件が４歳（現３歳）の牝馬限定から４歳（現３歳）以上の牝馬限定に変更され、同時に距離も芝2400ｍ（外回り）から芝2200ｍ（外回り）へと短縮された。これにより、本競走は牝馬三冠路線を戦ってきた４歳（現３歳）の実績馬と古馬の強豪牝馬が一堂に会し、覇を競い合う一戦としてリニューアルされた。現在では、晩秋の京都競馬場を華やかに彩る“３歳以上の女王決定戦”として親しまれている。
1995年から中央競馬指定交流競走として、所定の成績を収めた地方馬に出走が認められた。また地方馬は、2000年から「同年の京都大賞典、府中牝馬ステークスおよび秋華賞２着以内馬」に優先出走権が付与されたほか、ＪＲＡのGI 競走（２歳GI を除く）１着馬にも出走資格が与えられたが、2007年から指定された外国の国際G1 競走（２歳G1 を除く）優勝馬または地方競馬指定交流競走のGI・JpnI（２歳GI・JpnI を除く）優勝馬にも出走資格が与えられている。さらに1999年から国際競走に指定され、外国馬が５頭まで出走可能となったが、2007年の日本のパートI 国昇格に伴い、外国馬の出走枠が９頭に拡大された。2010年にスノーフェアリー（イギリス）が、海外調教馬として初の優勝を飾っており、翌2011年には連覇を成し遂げた。
また、本競走は2008年に創設された秋季国際GI 競走シリーズ『ジャパン・オータムインターナショナル』に指定されている。
2012年には、英国王室と縁の深いレースであるという背景から、英国連邦以外で一般的に許可されていないエリザベス女王即位60年記念「ダイヤモンドジュビリー」の日本での実施について特別の許可をいただき、「エリザベス女王即位60年記念」という冠名を付して行われた。
競走名：37回は(エリザベス女王即位60年記念)がつく。
欧文表記：1～36回は｢THE QUEEN ELIZABETH II COMMEMORATIVE CUP」。37回は｢THE QUEEN ELIZABETH II COMMEMORATIVE CUP - DIAMOND JUBILEE」
競馬場：4回は阪神。
距 離：1～20回は2,400m。
負担重量：1～20回は55㎏。
条 件：1～20回は3歳牝馬限定。1～23回は(混合)。20回から(指定)となる。24回から(国際)となる。
備 考：33回よりジャパン・オータムインターナショナルの構成レースとして施行。
降 着：21回、ヒシアマゾン・第2位入線→他馬の進路を妨害したため第7着に降着。31回、カワカミプリンセス・第1位入線(タイム2:11.4・着差1 1/2)→他馬の走行を妨害したため第12着に降着。
エリザベス女王杯レコード（京都・芝外2,200ｍ） 2:11.2 26回 トゥザヴィクトリー
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