為了保證婦女健康，藥物流產者必須在有條件的醫療機構中進行。其程序：
(1)用藥前嚴格篩選，包括詢問病史，進行全身體檢和婦科檢查，作實驗室檢查，如尿妊娠試驗、陰道清潔度、滴蟲和黴菌、血常規和血型化驗，必要時做B超檢查。
(2)醫生詳細交待服藥方法、藥物療效及可能出現的副作用，征得同意後方可用藥。
(3)目前常用劑量：米非司酮用量為150～200毫克，可以頓服或分次於3天內服完。於第3天到醫院加用前列腺素制劑：卡孕拴1毫克置於陰道內或米索前列醇600微克口服。在醫院中觀察6小時。
(4)流產過程中的監護：住院觀察期間除註意血壓、脈搏、藥物副作用外，所排出的大小便均需保留在幹凈便盆內，由專人檢查並記錄有無胎囊及其排出時間，胎囊大小和出血量。如排出胎囊前後有活動性出血，可給宮縮劑或立即刮宮止血。
(5)觀察6小時後如胎囊仍未排出，出血不多，可回家，按醫生規定日期隨診。如在家中排出組織，須帶給醫生察看。
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