塔什库尔干塔吉克自治县位于新疆维吾尔自治区西南部，西北、西南、南分别与塔吉克斯坦、阿富汗、巴基斯坦三国相连，东南和东部与叶城、莎车县相连，北与阿克陶县相连。总面积24088.82平方千米，总人口4万人（2008年）。有塔吉克、柯尔克孜、维吾尔、汉、回等民族。全县辖2个镇、11个乡（包括1个民族乡）：塔什库尔干镇、塔吉克阿巴提镇、塔什库尔干乡、塔合曼乡、科克亚尔柯尔克孜族乡、提孜那甫乡、达布达尔乡、马尔洋乡、瓦恰乡、班迪尔乡、库科西鲁格乡、布伦木沙乡、大同乡。县境内有麻扎尔种羊场、巴扎达什牧林场、牛奶场、布候依吉拉甫农场，中巴红其拉甫口岸、中塔卡拉苏口岸和中阿口岸。县政府驻塔什库尔干镇，距乌鲁木齐1765千米。
地处帕米尔高原东部。群山环抱，地势大致呈西南高而东北低。主要有叶尔羌河、塔什库尔干河等五条河流。地处高寒山区，属大陆型干旱性气候。314国道贯穿全境，北接喀什，南出红其拉甫口岸与巴基斯坦相通，西出卡拉苏口岸与塔吉克斯坦相连。名胜古迹有乔戈里峰（世界第二高峰，海拔8611米），世界“冰山之父”慕什塔格峰（海拔7546米），依色克布拉克温泉，塔什库尔干遗址（石头城，据考曾为唐渴盘陀国都城所在地），克孜库尔干遗址（公主堡）以及古驿站遗址等。