Kansallisarkistossa Vaasassa säilytetään alueen (Pohjanmaan, Keski-Pohjanmaan ja Etelä-Pohjanmaan liitot) piiri- ja paikallisviranomaisten arkistoja. Tänne on talletettu myös useita kirkollisia ja eräitä kunnallisia arkistoja. Viranomaisarkistojen lisäksi Vaasassa säilytetään useita satoja yksityisarkistoja kuten liikeyritysten, yhdistysten ja seurojen, kylien, talojen, sukujen, perheiden ja yksityishenkilöiden arkistoja.
Vanhin säilytettävä asiakirja on vuodelta 1407 peräisin oleva kauppakirja Norra Vallgrundin kyläarkistossa. Vanhimmat viranomaisten asiakirjat ovat 1600-luvulta, mutta asiakirjoista pääosa on myöhemmiltä vuosisadoilta. Yhteensä täällä säilytetään yli kymmenen hyllykilometriä viranomais- ja yksityisarkistoja, joihin sisältyy myös useita tuhansia karttoja.
Alkuperäisten asiakirjojen lisäksi säilytetään asiakirjatallenteita (mikrofilmit ja -kortit). Suurin osa mikrofilmeistä on kuitenkin jo digitoitu, kuten seurakuntien kirkonkirjat ja renovoidut tuomiokirjat. Digitoituihin aineistoihin kuuluu myös Savon tuomiokirja vuosilta 1563–1564.