Монастырь был открыт Священным Синодом УПЦ 30 марта 1999 г. и расположен на окраине Житомира, на руинах бывшей графской усадьбы, где в советские времена действовал противотуберкулезный санаторий.

10 августа 2009 г. Блаженнейший Владыка совершил свой Первосвятительский визит в Свято-Анастасиевский Житомирский женский монастырь, где согласно решению Священного Синода УПЦ от 9 июля 2009 года (журнал № 36) возвел в сан игумении Свято-Анастасиевской обители бывшую из насельниц Свято-Троицкого Корецкого женского монастыря монахиню Михаилу (Фурманец).

8 октября 2009 г. в день приставления преподобного Сергия Радонежского в Житомирскую епархию с Первосвятительским визитом прибыл Предстоятель УПЦ, Блаженнейший Владимир, Митрополит Киевский и всея Украины. По случаю престольного праздника теплого «зимнего» храма преподобного Сергия Радонежского и 10-летнего юбилея со дня основания Свято-Анастасиевского Житомирского женского монастыря Блаженнейший Митрополит Владимир возглавил праздничную Божественную литургию под открытым небом на площади перед Свято-Анастасиевский собором, который строится. Его Блаженству сослужили: Высокопреосвященнейший Гурий, Архиепископ Житомирский и Новоград-Волынский, Высокопреосвященнейший Павел, архиепископ Вышгородский (наместник Киево-Печерской Лавры), Преосвященнейший Владимир, Епископ Шепетовский и Славутский, Преосвященнейший Александр, Епископ Переяслав-Хмельницкий (секретарь Предстоятеля УПЦ), Преосвященнейший Александр, Епископ Городницкий (наместник Городницкого ставропигиального мужского монастыря), а также духовенство Житомирской, Киевской, Хмельницкой и других соседних епархий.

За богослужением также молились председатель городского совета Шелудченко Вера Тимофеевна, Председатель областного совета Француз Виталий Иосифович, секретарь администрации областного совета Орлов Игорь Виталиевич, а также представители депутатского корпуса области и города. По окончании литургии Блаженнейший Митрополит Владимир возглавил крестный ход вокруг Свято-Анастасиевского храма, в завершение которого отслужил заупокойную литию у места упокоения основательницы обители схимонахини Рафаилы (Чернецкой).

26 июня 2010 г. православные верующие Житомира торжественно отмечали сто седьмую годовщину перенесения из резиденции Волынских архиереев в Спасо-Преображенский кафедральный собор города Житомира великой святыни – главы святой прпмч. Анастасии Римляныни.

В этот день в Житомирскую епархию прибыл с однодневным визитом Предстоятель УПЦ Блаженнейший Владимир, Митрополит Киевский и всея Украины. Блаженнейшего Митрополита Владимира в Свято-Анастасиевской обители под звон колоколов, хлебом-солью и букетами цветов тепло встретили настоятельница игуменья Михаила (Фурманец) с сестрами, духовенство епархии, многочисленные верующие и паломники. По случаю престольного праздника Блаженнейший Митрополит Владимир возглавил Божественную литургию под открытым небом на площади перед строящимся Свято-Анастасиевским собором. Его Блаженству сослужили: архиепископы Белоцерковский и Богуславский Митрофан, Львовский и Галицкий Августин, Житомирский и Новоград-Волынский Гурий; Епископы: Уманский и Звенигородский Пантелеимон, Переяслов-Хмельницкий Александр и духовенство епархии.

5 января 2010 г в Житомирскую епархию прибыл с однодневным визитом Предстоятель УПЦ Блаженнейший Владимир, Митрополит Киевский и всея Украины. Его Блаженство совершил малое освящение храма, расположенного в цокольной части Свято-Анастасиевского собора, строящегося на территории Свято-Анастасиевского женского монастыря, в честь преподобного Серафима Саровского. Закладка собора состоялась 1 августа 2002 г.

10 февраля 2011 г. решением Священного Синода УПЦ (журнал № 7) Свято-Анастасиевскому женского монастыря был предоставлен статус ставропигии.

26 июня 2011 г. в день памяти святой прмч. Анастасии Римляныни, в Свято-Анастасиевском женском монастыре города Житомира отметили престольный праздник.

Божественную литургию, в нижнем храме имени прп. Серафима Саровского строящегося Свято-Анастасиевского монастыря совершили: митрополит Овручский и Коростенский Виссарион, архиепископ Переяслав-Хмельницкий и Вишневский Александр (секретарь Предстоятеля УПЦ), епископы: Уманский и Звенигородский Пантелеимон, Городницкий Александр и Рокитнянский Никодим.

По завершении Литургии на площади перед собором был отслужен молебен, после которого духовенство вместе с верующими прошли крестным ходом к монастырскому кладбищу, где была отправлена заупокойная лития по основательницей этой обители, схимонахиней Рафаилом (Чернецкой).

Напоследок, владыка Виссарион поздравил насельниц обители и паломников с престольным праздником, после чего секретарь Предстоятеля УПЦ архиепископ Александр передал присутствующим благословение и приветствие от Блаженнейшего Митрополита Владимира.

Трудами насельниц обители сооружения приобретают черты церковной архитектуры, возводятся новые корпуса. Возводятся жилые монашеские корпуса. Так в монастыре действует храм в честь преподобного Сергия Радонежского, колокольня, идет строительство собора в честь преподобномученицы Анастасии Римляныни с приделом преподобного Серафима Саровского.